*Essence

 ハルカ 様へ

…そうですか…当方手持ちの全文表示＋追記折り畳みカスタマイズ済みテンプレートではキチンとエラー無く表示されたのですが…（記事管理画面も問題無しです）。
ブログのソースを拝見・検証できれば一番良いのですけど、…難しそうですね。(・_・;)

colorbox以外で同様の、と言えば先般の返信で掲載した『Lightbox』が良いのでは？と思います。
https://kwave-studio.com/?p=107
Lightbox 『キャプションに外部リンクが貼れるようになっていた件』
しかも、新しいバージョンのLightbox2では、設置する必要なくCDN経由で読み込めるそうです。
https://allabout.co.jp/gm/gc/470618/（All Aboutの記事より）
是非、検討してみて下さい。

右往左往させてしまいました上に、ハルカ様のお力になれなくて…本当に申し訳ございませんでした。m(__)m

 ハルカ 様へ

分からないままでいるのが嫌なので、当方も『colorbox』入れて改善策を考えてみました。^^;
で、取り敢えず下記のページのガンダム画像をクリックして頂けますか？

https://sorauta1.blog.fc2.com/blog-entry-313.html

HTML終了タグチェックもエラーは無いはずです。(^_^)
jQueryやcolorbox.js、colorbox.css（背景色のみ黒＋透過度に変更、✖ボタンや矢印の画像はアップしてません）はそのままで、
<script>
$("a.open").colorbox();
</script>
同じように、アンカータグの class="open" で開くようにしました。

変更したのは画像を掲載する際、aタグのtitle="タイトル部分"の記述で、< を &lt; 、> を &gt; とする、それと記事上に掲載するimgタグにtitle属性を追加する、というだけです。
具体的には、

<a class="open" href="https://blog-imgs-126.fc2.com/s/o/r/sorauta1/gundam-utsunomiya.jpg" target="_blank" title="&lt;a href='https://e-ssence-main.jp/'&gt;ガンダム宇都宮パルコ&lt;/a&gt;"><img src="https://blog-imgs-126.fc2.com/s/o/r/sorauta1/gundam-utsunomiyas.jpg" alt="ガンダム宇都宮パルコ" width="400" height="300" title="ガンダム宇都宮パルコ"/></a>

こんな風に書いて有ります。
アンカーの開始タグが認識されていないので開始タグと終了タグの両方を特殊文字（文字実体参照）を使って記述してみました。
文字参照は、HTMLなどの直接記述できない文字や記号をそのまま表示されるように表記する際に用いられる方法です。
参考に。https://e-ssence-main.jp/tips-page/t-html-cr1.html　（当方のHPです^^;）
そして、…エラーは出なくなりました！＆リンクもされています！
しかし、画像をマウスオーバーするとtitleに入れた文字列が表示されてしまう…。
title属性自体は他の部分にも使われているので、javascriptやcssで非表示・削除する訳にもいかず、方法を探してみましたが見つからず。
http://bujin450.blogspot.com/2013/02/lightboxtitle.html
ただ、imgタグの方にtitleを付けるとそちらを優先して表示するというのを見付けたので、画像をクリックしてもらう誘導策としてもその方が良いかも…という事で採用。

…こんな方法は如何でしょうか？^^;

先般伺っていた『titleにリンク』という方法は、下記の記事が元になっているのではと思います。
https://kwave-studio.com/?p=107
Lightbox
『キャプションに外部リンクが貼れるようになっていた件』
残念ながら、colorboxでtitleを使ったリンク方法を色々探してみましたが有りませんでした。
元々オプションとしてのプロパティ『title』は固定titleとしての文字列で、方法が有っても各colorbox画像にjavascriptを記述する方法しか無いようです。
http://www.jacklmoore.com/colorbox/

面倒な書き方ですが、是非ご参考に。m(__)m

 ハルカ 様へ

う～ん、このタグ自体に問題は無いように見受けられます。（が、title属性の値としてアンカータグって…聞いた事無いけど良いのかしら？^^; colorboxのオプション設定に有るのかな？）
このタグ以外の、同じ記事内やページのプラグインに使っているアンカータグに問題は無いでしょうか？
</a>は有るのに<a href="～～～">が無いものとか、逆に<a href="～～～">は有るのに</a>が無いものとか。沢山有るのであれば、コピペで使いまわしているタグ等も疑ってみる必要が有ります。
また、エラーが出る前のタグも良く見て下さい。ず～っと前の記事（若しくはプラグイン内のリンク）から引きずって来ているのかもしれません。

確認したいHTMLのソース画面（プラグインのHTML編集や記事の編集旧画面とか）で、キーボードの『Ctrl＋Fキー』を押すと検索窓が出てきますので、</a>や</A>とかで検索して下さい。そして、キチンと対になっているかを確認してみて下さい。

文法チェックツールも参考にされると良いですね。
https://webliker.info/91098/
大変な作業だとは思いますが、宜しくお願い致します。
（メールでも良いので、URLをお教え頂ければお手伝い致しますm(__)m）

 ハルカ 様へ

ハルカ様、いつもご愛顧有難うございます。

Colorboxの件ですが、今現在まで不具合のご連絡を頂いておりませんので何とも言えないのですが…^^;
先ず、ご確認頂きたいのは、記述の際のタグミスが無いか、です。
今迄表示出来ていたものが表示されなくなった場合、疑う箇所は
・jQueryのバージョン
（テンプレートの更新で新しいものに変更致しましたが、その個所の改変をされていないのであれば無関係）
　https://sorauta1.blog.fc2.com/blog-entry-304.html（2/28更新記事）
・CDNのURLがhttpsになっていない
（元々、HTML内で読み込むjQueryはhttpsになっているので問題無し。但し、他にjQueryが有る場合は確認が必要）
・記述の際にタグを間違っている
（半角英数スペースで区切っていない若しくは全角になっている・終了タグが無い等、タグ自体にミスが有る）

HTMLで記述する際、ポップアップ表示したい<a>タグにクラス（例：class名はcolorbox）を付けます。
<a href="画像や記事のURL" class="colorbox" title="画像や記事の説明文">
<img src="画像のURL">
</a>

記事内のタグにclass属性など他の物を指定する際、前後は半角英数スペースで区切ります。
このスペースが全角になっていたり抜けていたりすると、記述しているclass="～"が反映しません。
それまでは問題無かったのにおかしくなった場合は、記事内の終了タグの不足、半角・全角スペースタグ、追加したscriptやプラグインを疑ってみて下さい。
それでも不具合が解消しない場合は、Secretで構わないのでハルカ様のブログURLで確認したいのでお教え頂けますか？
宜しくお願い致します。m(__)m

 ハルカ 様へ

ハルカ様、初めまして♪
この度は拙いテンプレートのご利用、誠に有難うございます。

ご質問の件です。
>①エントリー記事の全文表示記事と通常?表示をおりまぜる事は可能でしょうか？
…申し訳ございませんが出来ません。
全文表示のカスタマイズをした後に、要約表示風に見せる事は出来ますが、追記記事冒頭を要約したものは表示できません。
全文表示のカスタマイズをしても追記に入れた部分は折り畳みですので、記事を書く時に本文部分は触りだけ入れて、残りを追記部分に記述すれば要約風にはなります。
ただし、トップページでの『ReadMore』はあくまでも個別記事へのリンクで、個別記事に移動してからクリックで展開…という形です。
でないと、全てトップページのみで閲覧を完結させてしまい、誰も個別ページに来てくれない事になりますから。。
記事本文部分を要約表示風にするには、本文記述時に

<div class="left"><img src="掲載したい画像URL" alt="記事タイトルや画像名等"></div><div class="right"><div class="text_overflow"><p class="moji-c">表示したい文字列</p></div>

として（全部続けて記述）、追記部分に本来掲載したい文章を記述します。
但し（元々全文・要約表示の併用は出来ませんので）ソースはテンプレート本体には組み入れられないので、その都度記述の必要が有ります。m(__)m
画像が無ければそのまま『本文は触りをちょっと＆追記に掲載したい文章』で良いかと思います。

>②エントリー記事（プラグイン3）の上部にショッピングリサーチャーの広告が表示される
…GoogleChromeの拡張機能ですか？使った事が無いので当方にはよく分かりませんが、同じくGoogleChromeの拡張機能で『Adblock Plus』を入れれば広告が出なくなるようです。（当方、リサーチャーは入れてませんがAdblockは入れてます。）
『Adblock Plus』
https://chrome.google.com/webstore/detail/adblock-plus-free-ad-bloc/cfhdojbkjhnklbpkdaibdccddilifddb?utm_source=chrome-ntp-icon

これで試してみて頂けますか？

 どなるど 様へ

こちらこそ、明けましておめでとうございます。本年も宜しくお願い致します。m(__)m

早速のご指摘！有難うございます！
実は丁度、全文表示を施した見本用複製テンプレを見ていて「あれ～～？」なんて思ってたところでして、カスタマイズ記事内のHTMLを凝視しておりました。^^;
見付けて頂き有難うございます♪早速記事を修正致しました。
そして…見本用複製テンプレの不具合も無事に直りました。(;´∀｀) 有難うございました！

先程、どなるど様のブログを拝見して、私は実家の在る新潟の『中越地震』を思い出しました。
2004年10月、車で自宅の駐車場に戻って来た時、富山に居る旦那と携帯で話している時に突然の地震！
周りの車が皆上下にジャンプを始めて、車中から旦那に電話で実況してたのを思い出します…。
その後の余震もマジで怖かった…。
月日の経つのは早いけど、心の中に深く刻まれている事が有ります。ずっと。
忘れられないし、忘れたくないし、忘れません。

読んでて、（旦那様との所）とっても良い話だなぁ～と思いました。(^-^)

p.s. 同世代ですか？なめ猫や横浜銀蝿は中学生の頃でしたが。www
去年、カラオケでピンクレディーメドレーを歌って踊ったら、歌と振り付けは覚えているのに身体が付いていけない『年齢という重石』を感じてしまいました。(;'∀')

 どなるど 様、有難うございます。m(__)m

どなるど様、修正及びご連絡頂き、有難うございます。
先程、当方も症状の検証がてら画像高速表示の広告を適用してみました。
で、…出ますね。仰る通りです。^^;
確かに高速表示広告が有ると追記下に文字が出て広告もダブルで出ます。（無ければ出ないようです。）
干渉しているのは、HTML内に有るコメントアウトした文言に有る『FC2ブログの独自単変数』<%topentry_more>の左右山括弧と、自動で挿入される広告タグのようですね。
試しにコメントアウトの山括弧を削除してみたら…追記開閉OK・広告重複表示無し・「を入れる -->」の文字も無し、になりました。
本来コメント内にHTMLタグを挟むことも可能なため、独自タグも大丈夫かな～と思ってたので（認識が）甘かったみたいです。(-_-;)

画像高速表示用広告＋コメントアウト内の山括弧 で起きる事象（だと思う）は、他の方も成り得るものなので、この度の貴殿からのご連絡は大変有益な情報です。
後程、当方の記事も追記・修正させて頂きます。
改めまして、本当に有難うございました。m(__)m
また何かお気付きの点などがございましたら、何なりとお声掛け下さいませ。
拙いテンプレートですが、今後とも末永くお付き合い下さいます様 宜しくお願い致します。

p.s. ブログを拝見して、ご長寿の猫ちゃん達が幸せそうです。(^-^)
うちは大人野良猫を保護してもうすぐ1年、まだまだ未熟な飼い主なので、毎夜の雄叫びと運動会で寝不足状態。(;^_^A
永く生活されている猫飼い様を尊敬しちゃいます。。

 Read More の件です

どなるど様、
先ずは下記の画像をご覧頂いて、HTML編集枠を修正して下さい。
https://blog-imgs-123-origin.fc2.com/s/o/r/sorauta1/ct-customize2.gif

記事ページの追記開閉不要の部分を削除したのだと思いますが、削除が不十分です。
貴殿のブログソースを拝見すると、

<!-- 記事ページの追記開閉が不要の場合はここまでを削除し、この部分に

という文言・及びその後の

を入れる -->

という文字が削除されていません。削除された後のこの部分は、

<!--more-->
<%topentry_more>
<!--/more-->
</div>

になっていなければいけません。
この部分がキレイに削除されていないため変な表示をしているのだと思います。
修正してご確認頂けますか？宜しくお願い致します。m(__)m

 どなるど 様へ

どなるど様、初めまして。
数あるテンプレートの中からご利用頂き、誠に有難うございます。m(__)m

症状なのですが、当方の持っているandroidスマホで閲覧すると全文表示になるので安心しておったのですが…で、実機の横幅400px以上だったので全文表示出来たのかもと思いまして、ひょっとしてスマホの幅の問題なのかな？と。
実機での確認は必要では有るけど、これだけ色んなサイズが有るとやっぱり無理が有りますね。^^;

改善方法なのですが、下記の方法を試してみて頂けますか？
スタイルシート編集枠下段の方（上から9/10位）に
@media only screen and (max-width:400px) {
という部分が有ります。その下を見ていくと

.kiji1{
display:block; /* 要約表示時記事非表示 */
margin:0;
}

という部分が有りますので、ここの display:block; を display:none; にして更新してみて下さい。

この方法で改善できましたら、全文表示カスタマイズの記事を修正させて頂きたいのですが…如何でしょうか？
宜しければ結果をお教え下さいませ。m(__)m